近年来，随着互联网和电子商务的快速发展，丰台区的网鞋产业得到了迅速发展。然而，同时也面临着自主创新和知识产权保护的重要问题。

为了实现自主创新，丰台区的网鞋企业需要加强科技研发，持续提高技术创新能力。通过开展国际合作、引进优秀人才等方式，积极推动产品质量和技术水平的提高。同时，还可以注重设计和品牌建设，提升产品的差异化竞争力。

在知识产权保护方面，丰台区的网鞋企业应该加强法律意识，依法保护自己的知识产权。加强知识产权管理和维权工作，完善知识产权保护体系。此外，还应该加强知识产权交流和合作，与其他企业共同推动整个行业的知识产权保护工作。

总之，丰台区的网鞋产业要想实现可持续发展，必须注重自主创新和知识产权保护。只有这样，才能在激烈的市场竞争中抢占更大的市场份额，实现更好的经济效益和社会效益。